2.2 SQUARE_CLOSEUP_NORTH OVAL OVAL OVAL OVAL OVAL inactive active inactive inactive active inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive active inactive inactive inactive active inactive inactive inactive inactive inactive inactive active inactive active inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive active inactive inactive inactive inactive inactive active inactive inactive inactive inactive inactive active inactive inactive inactive inactive inactive active inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive inactive Neuron Golgi Lysosome Vesicle Nucleus Long Name: Furin Synonym: Synonym not specified Accession: P00105 inside PROTEIN p4 Long Name: TNF-alpha converting enzyme Synonym: ADAM17,alpha-secretase Accession: P00092 inside PROTEIN p8 Long Name: Gene transcription Synonym: Synonym not specified Accession: U02059 inside PHENOTYPE Gene_br_transcription Long Name: Amino terminal fragment of amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00104 inside PROTEIN p16 Long Name: Amyloid precursor binding protein, family B Synonym: Rir Accession: P00087 inside PROTEIN p39 Long Name: Long Name: Ca2+ Synonym: Synonym not specified Accession: U05008 inside ION Ca_super_2+_endsuper Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05000 Heterodimer Member Info: Fe65#PROTEIN#Amyloid precursor binding protein, family B#P00087#Rir#;C99#PROTEIN#Carboxy-terminal 99 amino acids of amyloid precursor protein#P00106## innerSurface PROTEIN p17 PROTEIN p39 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05007 Heterodimer Member Info: AICD#PROTEIN#Amyloid precursor protein intracellular domain#P00080##;Fe65#PROTEIN#Amyloid precursor binding protein, family B#P00087#Rir# inside PROTEIN p20 PROTEIN p39 Long Name: Amyloid precursor binding protein, family A Synonym: D9S411E,MINT1 Accession: P00084 inside PROTEIN p60 Long Name: Amyloid precursor protein alpha ectodomain Synonym: Synonym not specified Accession: P00097 inside PROTEIN p61 Long Name: Carboxy-terminal 83 amino acids of amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00100 innerSurface PROTEIN p62 Long Name: meltrin gamma Synonym: ADAM9 Accession: P00090 inside PROTEIN p63 Long Name: A disintegrase and metalloprotease 10 Synonym: Synonym not specified Accession: P00108 inside PROTEIN p64 Long Name: p3 Synonym: Synonym not specified Accession: P00086 inside PROTEIN p65 Long Name: Amyloid precursor protein intracellular domain Synonym: Synonym not specified Accession: P00080 inside PROTEIN p20 Long Name: HIV-1 Tat interactive protein, 60kDa Synonym: HTATIP1,PLIP,TIP,TIP60,cPLA2 Accession: P00093 inside PROTEIN p66 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U04999 Heterodimer Member Info: AICD#PROTEIN#Amyloid precursor protein intracellular domain#P00080##;Fe65#PROTEIN#Amyloid precursor binding protein, family B#P00087#Rir#;Tip60#PROTEIN#HIV-1 Tat interactive protein, 60kDa#P00093#HTATIP1|PLIP|TIP|TIP60|cPLA2# inside PROTEIN p20 PROTEIN p39 PROTEIN p66 Long Name: Cholesterol Synonym: Synonym not specified Accession: S01595 inside SIMPLE_MOLECULE Cholesterol Long Name: Protein kinase C Synonym: Synonym not specified Accession: P00109 inside PROTEIN p67 Long Name: Muscarinic acetylcholine receptors Synonym: Synonym not specified Accession: P00083 transmembrane PROTEIN p69 Long Name: alpha7 nicotinic acetylcholine receptor Synonym: Synonym not specified Accession: P00079 transmembrane PROTEIN p70 Long Name: Long Name: Ca2+ Synonym: Synonym not specified Accession: U05008 inside ION Ca_super_2+_endsuper Long Name: L-type calcium channels Synonym: Synonym not specified Accession: P00082 transmembrane PROTEIN p72 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U04998 Heterodimer Member Info: AICD#PROTEIN#Amyloid precursor protein intracellular domain#P00080##;Fe65#PROTEIN#Amyloid precursor binding protein, family B#P00087#Rir# inside PROTEIN p20 PROTEIN p39 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05002 Heterodimer Member Info: Microtubule#PROTEIN#Microtubule#P00103##;kinesin#PROTEIN#kinesin#P00107## inside PROTEIN p75 PROTEIN p76 Long Name: Mitogen activated protein kinase Synonym: ERK Accession: P00099 inside PROTEIN p71 Long Name: a269_degraded Synonym: Synonym not specified Accession: U02060 inside DEGRADED a269_degraded Long Name: Presenilin Synonym: sel-12 Accession: P00098 inside PROTEIN p10 Long Name: Nicastrin Synonym: Synonym not specified Accession: P00095 transmembrane PROTEIN p12 Long Name: Anterior pharynx defective-1 Synonym: Synonym not specified Accession: P00091 transmembrane PROTEIN p11 Long Name: Presenilin enhancer 2 Synonym: Synonym not specified Accession: P00089 transmembrane PROTEIN p13 Long Name: Presenilin N-terminal fragment Synonym: Synonym not specified Accession: P00088 transmembrane PROTEIN p78 Long Name: Presenilin C-terminal fragment Synonym: Synonym not specified Accession: P00102 inside PROTEIN p79 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05004 Heterodimer Member Info: Presenilin N-terminal fragment#PROTEIN#Presenilin N-terminal fragment#P00088##;Pen-2#PROTEIN#Presenilin enhancer 2#P00089##;Aph-1#PROTEIN#Anterior pharynx defective-1#P00091##;Nicastrin#PROTEIN#Nicastrin#P00095##;Presenilin C-terminal fragment#PROTEIN#Presenilin C-terminal fragment#P00102## inside PROTEIN p12 PROTEIN p11 PROTEIN p13 PROTEIN p78 PROTEIN p79 Long Name: Beta-amyloid Synonym: Abeta1-40,Abeta1-42 Accession: P00096 inside PROTEIN p19 Long Name: Beta-amyloid Synonym: Abeta1-40,Abeta1-42 Accession: P00096 inside PROTEIN p19 8 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05001 Heterodimer Member Info: alpha7 nicotinic acetylcholine receptor#PROTEIN#alpha7 nicotinic acetylcholine receptor#P00079##;Abeta#PROTEIN#Beta-amyloid#P00096#Abeta1-40|Abeta1-42# transmembrane PROTEIN p70 PROTEIN p19 Long Name: Beta-amyloid Synonym: Abeta1-40,Abeta1-42 Accession: P00096 inside PROTEIN p19 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05003 Heterodimer Member Info: Presenilin N-terminal fragment#PROTEIN#Presenilin N-terminal fragment#P00088##;Pen-2#PROTEIN#Presenilin enhancer 2#P00089##;Aph-1#PROTEIN#Anterior pharynx defective-1#P00091##;Nicastrin#PROTEIN#Nicastrin#P00095##;Presenilin C-terminal fragment#PROTEIN#Presenilin C-terminal fragment#P00102## transmembrane PROTEIN p12 PROTEIN p11 PROTEIN p13 PROTEIN p78 PROTEIN p79 Long Name: Beta-site amyloid precursor protein-cleaving enzyme Synonym: Asp2,asp-2,beta-secretase,memapsin,memapsin-2 Accession: P00101 inside PROTEIN p18 Long Name: Amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00085 transmembrane PROTEIN p15 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U04997 Heterodimer Member Info: APP#PROTEIN#Amyloid precursor protein#P00085##;Fe65#PROTEIN#Amyloid precursor binding protein, family B#P00087#Rir# transmembrane PROTEIN p15 PROTEIN p39 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05005 Heterodimer Member Info: X11alpha#PROTEIN#Amyloid precursor binding protein, family A#P00084#D9S411E|MINT1#;APP#PROTEIN#Amyloid precursor protein#P00085## transmembrane PROTEIN p60 PROTEIN p15 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U04995 Heterodimer Member Info: APP#PROTEIN#Amyloid precursor protein#P00085##;Microtubule#PROTEIN#Microtubule#P00103##;kinesin#PROTEIN#kinesin#P00107## transmembrane PROTEIN p15 PROTEIN p75 PROTEIN p76 Long Name: Amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00085 transmembrane PROTEIN p15 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U05006 Heterodimer Member Info: X11alpha#PROTEIN#Amyloid precursor binding protein, family A#P00084#D9S411E|MINT1#;APP#PROTEIN#Amyloid precursor protein#P00085## transmembrane PROTEIN p60 PROTEIN p15 Long Name: Amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00085 transmembrane PROTEIN p15 Long Name: Beta-amyloid Synonym: Abeta1-40,Abeta1-42 Accession: P00096 inside PROTEIN p19 Long Name: Amino terminal fragment of amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00104 inside PROTEIN p16 Long Name: Carboxy-terminal 99 amino acids of amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00106 transmembrane PROTEIN p17 Long Name: BACE-1 pro-domain Synonym: Synonym not specified Accession: P00094 inside PROTEIN p74 Long Name: Pro-BACE-1 Synonym: Asp-2,Aspartyl protease 2,Memapsin Accession: P00081 transmembrane PROTEIN p73 Long Name: Beta-site amyloid precursor protein-cleaving enzyme Synonym: Asp2,asp-2,beta-secretase,memapsin,memapsin-2 Accession: P00101 inside PROTEIN p18 Long Name: Amino terminal fragment of amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00104 inside PROTEIN p16 Long Name: Carboxy-terminal 99 amino acids of amyloid precursor protein Synonym: Synonym not specified Accession: P00106 outerSurface PROTEIN p17 Long Name: Beta-site amyloid precursor protein-cleaving enzyme Synonym: Asp2,asp-2,beta-secretase,memapsin,memapsin-2 Accession: P00101 transmembrane PROTEIN p18 Long Name: Long Name: Long name not specified Synonym: Synonym not specified Accession: U04996 Heterodimer Member Info: Presenilin N-terminal fragment#PROTEIN#Presenilin N-terminal fragment#P00088##;Pen-2#PROTEIN#Presenilin enhancer 2#P00089##;Aph-1#PROTEIN#Anterior pharynx defective-1#P00091##;Nicastrin#PROTEIN#Nicastrin#P00095##;Presenilin C-terminal fragment#PROTEIN#Presenilin C-terminal fragment#P00102## transmembrane PROTEIN p12 PROTEIN p11 PROTEIN p13 PROTEIN p78 PROTEIN p79 TRANSPORT s192 s147 0.33333333333333304,1.1102230246251565E-16 0.6666666666666661,1.1102230246251565E-16 a180 a181 HETERODIMER_ASSOCIATION s40,s80 s154 0.3333333333333339,-1.1102230246251565E-16 0.6666666666666679,-1.1102230246251565E-16 0.33333333333333304,3.552713678800501E-15 0.666666666666667,1.7763568394002505E-15 0.3333333333333357,1.7763568394002505E-15 0.6666666666666679,3.552713678800501E-15 0.33333333333333304,0.33333333333333304 a184 a83 a186 TRUNCATION s156 s44,s161 0.3333333333333339,8.881784197001252E-16 0.6666666666666679,8.881784197001252E-16 0.33333333333333287,0.0 0.6666666666666667,3.552713678800501E-15 0.3333333333333339,8.881784197001252E-16 0.6666666666666661,8.881784197001252E-16 0.33333333333333326,0.3333333333333339 a188 a52 a195 TRUNCATION s154 s41,s156 0.33333333333333215,8.881784197001252E-16 0.6666666666666661,0.0 0.33333333333333304,0.0 0.666666666666667,1.7763568394002505E-15 0.33333333333333215,2.220446049250313E-16 0.6666666666666661,-2.220446049250313E-16 0.33333333333333304,0.33333333333333126 a186 a49 a188 HETERODIMER_ASSOCIATION s163,s40 s165 0.3333333333333339,0.0 0.6666666666666661,1.7763568394002505E-15 0.3333333333333339,-1.7763568394002505E-15 0.6666666666666679,-1.7763568394002505E-15 0.3333333333333339,-1.1449174941446927E-16 0.6666666666666661,-1.1449174941446927E-16 0.3333333333333339,0.3333333333333339 a197 a184 a200 TRUNCATION s40 s167,s168 0.3333333333333339,-8.881784197001252E-16 0.6666666666666679,-8.881784197001252E-16 0.3333333333333339,6.661338147750939E-16 0.6666666666666661,1.5543122344752192E-15 0.3333333333333326,0.0 0.6666666666666639,0.0 0.33333333333333304,0.33333333333333437 a201 a202 a203 TRUNCATION s168 s171,s172 0.3333333333333339,8.881784197001252E-16 0.6666666666666679,1.7763568394002505E-15 0.33333333333333215,4.440892098500626E-16 0.6666666666666679,-1.3322676295501878E-15 0.33333333333333337,0.0 0.6666666666666655,-1.7763568394002505E-15 0.33333333333333304,0.33333333333333304 a203 a206 a208 STATE_TRANSITION s44 s173 0.3333333333333339,-8.881784197001252E-16 0.6666666666666679,-1.7763568394002505E-15 a52 a211 HETERODIMER_ASSOCIATION s174,s217 s180 0.33333333333333215,1.7763568394002505E-15 0.6666666666666679,1.7763568394002505E-15 0.33333333333333925,0.0 0.6666666666666714,-3.552713678800501E-15 0.33333333333333304,0.0 0.6666666666666652,0.0 0.3333333333333357,0.3333333333333335 a212 a196 a219 STATE_TRANSITION s182 s182 0.3333333333333339,0.0 0.6666666666666661,0.0 a221 a222 STATE_TRANSITION s22 s22 0.33333333333333215,-8.881784197001252E-16 0.6666666666666661,-8.881784197001252E-16 a223 a27 STATE_TRANSITION s221 s221 0.3333333333333339,-8.881784197001252E-16 0.6666666666666661,-1.7763568394002505E-15 a227 a228 HETERODIMER_ASSOCIATION s44,s187 s191 0.33333333333333215,-1.1102230246251565E-15 0.6666666666666661,2.220446049250313E-16 0.33333333333333437,-7.105427357601002E-15 0.6666666666666683,0.0 0.33333333333333215,0.0 0.6666666666666679,-4.440892098500626E-16 0.3333333333333335,0.3333333333333339 a52 a229 a235 TRUNCATION s196 s259,s198 0.33333333333333925,-1.9984014443252818E-15 0.6666666666666714,-1.9984014443252818E-15 0.33333333333333215,0.0 0.6666666666666679,1.7763568394002505E-15 0.33333333333333304,0.0 0.6666666666666687,-3.552713678800501E-15 0.33333333333333304,0.33333333333333215 a239 a240 a241 TRUNCATION s213 s205,s208 0.33333333333333215,0.0 0.6666666666666679,0.0 0.3333333333333304,3.552713678800501E-15 0.6666666666666643,0.0 0.3333333333333357,3.552713678800501E-15 0.6666666666666714,3.552713678800501E-15 0.33333333333333215,0.33333333333333925 a256 a247 a251 TRUNCATION s208 s206,s172 0.33333333333333215,0.0 0.6666666666666679,-3.552713678800501E-15 0.3333333333333339,0.0 0.6666666666666679,0.0 0.3333333333333357,-1.7763568394002505E-15 0.6666666666666714,-5.329070518200751E-15 0.3333333333333339,0.33333333333333215 a251 a249 a253 HETERODIMER_ASSOCIATION s199,s220 s213 0.33333333333333215,-8.881784197001252E-16 0.6666666666666661,8.881784197001252E-16 0.3333333333333304,0.0 0.6666666666666661,0.0 0.3333333333333357,0.0 0.6666666666666679,0.0 0.3333333333333329,0.3333333333333339 a265 a268 a256 STATE_TRANSITION s222 s223 0.3333333333333339,0.0 0.666666666666667,0.0 a269 a270 TRUNCATION s231 s236,s237 0.3333333333333357,1.1102230246251565E-16 0.6666666666666679,-7.771561172376096E-16 0.33333333333333304,0.0 0.6666666666666687,0.0 0.33333333333333215,-8.881784197001252E-16 0.6666666666666643,0.0 0.3333333333333304,0.33333333333333215 a284 a289 a290 HETERODIMER_ASSOCIATION s237,s236 s260 0.33333333333333215,0.0 0.6666666666666679,0.0 0.33333333333333304,-1.7763568394002505E-15 0.6666666666666661,-1.7763568394002505E-15 0.3333333333333335,1.7763568394002505E-15 0.6666666666666665,0.0 0.3333333333333339,0.3333333333333339 a290 a289 a285 a287 a286 a310 DISSOCIATION s213 s208,s220 0.33333333333333215,-2.220446049250313E-16 0.6666666666666661,2.220446049250313E-16 0.3333333333333357,0.0 0.6666666666666785,-3.552713678800501E-15 0.33333333333333215,-1.6653345369377348E-16 0.6666666666666661,-1.0547118733938987E-15 0.3333333333333339,0.3333333333333339 a256 a251 a318 TRUNCATION s268 s272,s271 0.3333333333333357,2.220446049250313E-16 0.6666666666666679,2.220446049250313E-16 0.3333333333333348,0.0 0.666666666666667,0.0 0.3333333333333357,-1.7763568394002505E-15 0.6666666666666679,0.0 0.33333333333333215,0.33333333333333304 a333 a334 a332 TRUNCATION s272 s269,s172 0.33333333333333215,8.881784197001252E-16 0.6666666666666643,-8.881784197001252E-16 0.33333333333333215,3.552713678800501E-15 0.6666666666666661,0.0 0.33333333333333925,3.552713678800501E-15 0.6666666666666679,0.0 0.3333333333333305,0.3333333333333357 a334 a329 a336 TRANSPORT s165 s222 0.3333333333333339,4.440892098500626E-16 0.666666666666667,0.0 a200 a269 TRANSPORT s161 s217 0.3333333333333339,4.440892098500626E-16 0.666666666666667,0.0 a195 a196 UNKNOWN_TRANSITION s180 s39 0.3333333333333339,4.440892098500626E-16 0.6666666666666661,0.0 a219 a47 TRANSPORT s259 s43 0.6009401159894966,0.39322805273182015 0.8987561128753149,0.36127362769033033 a240 a51 TRANSPORT s260 s253 0.3333333333333336,0.0 0.6666666666666669,0.0 a310 a311